Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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