Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0408Q6ZU52 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0408Q6ZU52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms