Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM43Q6ZSC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms