Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms