Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms