Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP12Q6UXS9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms