Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LRIG3Q6UXM1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms