Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNNM4Q6P4Q7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms