Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC42EP5Q6NZY7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms