Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAVIN1Q6NZI2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms