Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms