Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms