Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF123Q5XPI4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF123Q5XPI4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms