Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SAMD13Q5VXD3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms