Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF20Q5VTR2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF20Q5VTR2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms