Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGAP9Q5VTM2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms