Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RSPH4AQ5TD94 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RSPH4AQ5TD94 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms