Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHYHD1Q5SRE7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms