Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms