Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms