Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC93Q567U6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms