Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms