Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFTN2Q52LD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFTN2Q52LD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms