Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms