Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms