Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC96Q2M329 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms