Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
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FOXD1Q16676 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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FOXD1Q16676 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
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