Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NTRK2Q16620 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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