Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECM1Q16610 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECM1Q16610 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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