Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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