Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRY1Q16526 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms