Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RYR3Q15413 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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