Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms