Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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