Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCAPHQ15003 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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