Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD4Q14839 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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CHD4Q14839 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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CHD4Q14839 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD4Q14839 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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