Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC1AQ14683 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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