Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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