Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDE1CQ14123 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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