Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2H3Q13889 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2H3Q13889 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms