Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOFQ13790 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOFQ13790 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOFQ13790 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOFQ13790 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOFQ13790 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOFQ13790 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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