Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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