Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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