Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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