Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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