Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLF1Q13351 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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