Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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