Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SELENBP1Q13228 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SELENBP1Q13228 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms