Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPS1Q13098 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPS1Q13098 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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