Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRDNQ13061 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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